Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM72Q6ZMU5 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms