Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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