Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms