Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP6Q16828 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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