Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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