Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms