Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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