Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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DDB1Q16531 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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DDB1Q16531 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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DDB1Q16531 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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DDB1Q16531 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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DDB1Q16531 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
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DDB1Q16531 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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DDB1Q16531 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
DDB1Q16531 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DDB1Q16531 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
DDB1Q16531 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DDB1Q16531 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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