Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP2Q16527 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms