Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms