Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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