Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms