Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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