Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms