Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
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