Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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