Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms