Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
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SHROOM2Q13796 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
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SHROOM2Q13796 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
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