Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms