Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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PMS2P11Q13670 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PMS2P11Q13670 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PMS2P11Q13670 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PMS2P11Q13670 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PMS2P11Q13670 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PMS2P11Q13670 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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