Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms