Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms