Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms