Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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