Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
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AP3B2Q13367 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
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