Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NME3Q13232 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NME3Q13232 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NME3Q13232 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NME3Q13232 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NME3Q13232 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NME3Q13232 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NME3Q13232 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NME3Q13232 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NME3Q13232 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NME3Q13232 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NME3Q13232 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NME3Q13232 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NME3Q13232 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NME3Q13232 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NME3Q13232 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NME3Q13232 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NME3Q13232 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NME3Q13232 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NME3Q13232 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NME3Q13232 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NME3Q13232 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NME3Q13232 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NME3Q13232 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NME3Q13232 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NME3Q13232 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NME3Q13232 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NME3Q13232 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NME3Q13232 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NME3Q13232 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NME3Q13232 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NME3Q13232 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NME3Q13232 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NME3Q13232 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NME3Q13232 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NME3Q13232 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NME3Q13232 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NME3Q13232 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NME3Q13232 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NME3Q13232 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NME3Q13232 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NME3Q13232 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NME3Q13232 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NME3Q13232 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NME3Q13232 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NME3Q13232 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NME3Q13232 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NME3Q13232 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NME3Q13232 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NME3Q13232 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NME3Q13232 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NME3Q13232 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NME3Q13232 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NME3Q13232 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NME3Q13232 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NME3Q13232 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NME3Q13232 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NME3Q13232 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NME3Q13232 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NME3Q13232 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NME3Q13232 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NME3Q13232 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NME3Q13232 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NME3Q13232 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NME3Q13232 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NME3Q13232 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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NME3Q13232 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NME3Q13232 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
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NME3Q13232 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NME3Q13232 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NME3Q13232 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NME3Q13232 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NME3Q13232 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NME3Q13232 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NME3Q13232 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NME3Q13232 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NME3Q13232 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NME3Q13232 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NME3Q13232 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NME3Q13232 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME3Q13232 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME3Q13232 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME3Q13232 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME3Q13232 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME3Q13232 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME3Q13232 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME3Q13232 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME3Q13232 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME3Q13232 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME3Q13232 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME3Q13232 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME3Q13232 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME3Q13232 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME3Q13232 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME3Q13232 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME3Q13232 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME3Q13232 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME3Q13232 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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