Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CBX3Q13185 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CBX3Q13185 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CBX3Q13185 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CBX3Q13185 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CBX3Q13185 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX3Q13185 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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CBX3Q13185 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CBX3Q13185 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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CBX3Q13185 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CBX3Q13185 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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