Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
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TRAF1Q13077 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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TRAF1Q13077 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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