Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms