Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms