Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms