Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 TNFAIP3-211ENST00000621150 1613 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC005225.3-201ENST00000555972 519 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 R3HCC1L-206ENST00000613938 1397 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms