Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms