Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms