Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms