Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms