Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCN7AQ01118 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCN7AQ01118 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SCN7AQ01118 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCN7AQ01118 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCN7AQ01118 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SCN7AQ01118 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCN7AQ01118 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCN7AQ01118 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCN7AQ01118 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCN7AQ01118 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCN7AQ01118 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCN7AQ01118 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms