Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms