Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BEX3Q00994 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms