Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms