Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms