Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD2P62316 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNRPD2P62316 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SNRPD2P62316 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNRPD2P62316 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SNRPD2P62316 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SNRPD2P62316 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNRPD2P62316 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNRPD2P62316 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNRPD2P62316 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms