Protein–RNA interactions for Protein: P57721

PCBP3, Poly(rC)-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP3P57721 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms