Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO3P55854 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO3P55854 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO3P55854 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO3P55854 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO3P55854 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO3P55854 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SUMO3P55854 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SUMO3P55854 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SUMO3P55854 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SUMO3P55854 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SUMO3P55854 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SUMO3P55854 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SUMO3P55854 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SUMO3P55854 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SUMO3P55854 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SUMO3P55854 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SUMO3P55854 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SUMO3P55854 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SUMO3P55854 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SUMO3P55854 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SUMO3P55854 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SUMO3P55854 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SUMO3P55854 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SUMO3P55854 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SUMO3P55854 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SUMO3P55854 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SUMO3P55854 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SUMO3P55854 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SUMO3P55854 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SUMO3P55854 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SUMO3P55854 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SUMO3P55854 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SUMO3P55854 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SUMO3P55854 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SUMO3P55854 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SUMO3P55854 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SUMO3P55854 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SUMO3P55854 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SUMO3P55854 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SUMO3P55854 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SUMO3P55854 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SUMO3P55854 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms