Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTPAP49638 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTPAP49638 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TTPAP49638 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TTPAP49638 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TTPAP49638 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TTPAP49638 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TTPAP49638 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TTPAP49638 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TTPAP49638 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TTPAP49638 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TTPAP49638 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTPAP49638 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTPAP49638 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTPAP49638 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTPAP49638 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTPAP49638 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTPAP49638 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTPAP49638 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTPAP49638 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTPAP49638 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTPAP49638 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTPAP49638 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTPAP49638 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTPAP49638 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTPAP49638 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTPAP49638 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTPAP49638 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTPAP49638 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTPAP49638 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTPAP49638 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTPAP49638 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTPAP49638 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTPAP49638 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTPAP49638 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTPAP49638 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTPAP49638 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TTPAP49638 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTPAP49638 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTPAP49638 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTPAP49638 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTPAP49638 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTPAP49638 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTPAP49638 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTPAP49638 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTPAP49638 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTPAP49638 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTPAP49638 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTPAP49638 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTPAP49638 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTPAP49638 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTPAP49638 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTPAP49638 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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