Protein–RNA interactions for Protein: P49189

ALDH9A1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH9A1P49189 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALDH9A1P49189 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms