Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRATP43155 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRATP43155 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRATP43155 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRATP43155 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRATP43155 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRATP43155 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRATP43155 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRATP43155 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRATP43155 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRATP43155 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRATP43155 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRATP43155 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRATP43155 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRATP43155 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CRATP43155 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRATP43155 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRATP43155 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRATP43155 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRATP43155 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRATP43155 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRATP43155 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRATP43155 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRATP43155 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRATP43155 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRATP43155 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRATP43155 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRATP43155 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CRATP43155 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CRATP43155 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRATP43155 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRATP43155 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRATP43155 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRATP43155 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRATP43155 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRATP43155 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRATP43155 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRATP43155 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRATP43155 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRATP43155 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRATP43155 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CRATP43155 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms