Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL1P40616 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL1P40616 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL1P40616 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL1P40616 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL1P40616 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL1P40616 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL1P40616 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL1P40616 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL1P40616 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL1P40616 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL1P40616 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL1P40616 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL1P40616 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL1P40616 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL1P40616 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL1P40616 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL1P40616 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL1P40616 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL1P40616 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL1P40616 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL1P40616 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL1P40616 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL1P40616 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL1P40616 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL1P40616 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL1P40616 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL1P40616 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL1P40616 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL1P40616 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL1P40616 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL1P40616 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL1P40616 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL1P40616 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL1P40616 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL1P40616 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL1P40616 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL1P40616 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL1P40616 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL1P40616 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL1P40616 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL1P40616 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL1P40616 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL1P40616 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL1P40616 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL1P40616 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL1P40616 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL1P40616 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL1P40616 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL1P40616 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL1P40616 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL1P40616 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL1P40616 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL1P40616 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL1P40616 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL1P40616 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL1P40616 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL1P40616 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL1P40616 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL1P40616 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL1P40616 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL1P40616 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL1P40616 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL1P40616 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL1P40616 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL1P40616 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL1P40616 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL1P40616 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL1P40616 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL1P40616 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL1P40616 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL1P40616 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL1P40616 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL1P40616 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL1P40616 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL1P40616 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL1P40616 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL1P40616 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL1P40616 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL1P40616 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL1P40616 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL1P40616 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL1P40616 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL1P40616 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARL1P40616 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARL1P40616 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARL1P40616 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARL1P40616 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARL1P40616 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARL1P40616 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARL1P40616 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARL1P40616 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARL1P40616 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARL1P40616 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARL1P40616 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARL1P40616 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARL1P40616 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARL1P40616 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARL1P40616 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARL1P40616 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms