Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTX2P32243 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTX2P32243 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTX2P32243 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTX2P32243 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTX2P32243 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTX2P32243 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTX2P32243 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTX2P32243 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
OTX2P32243 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTX2P32243 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTX2P32243 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTX2P32243 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTX2P32243 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTX2P32243 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTX2P32243 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTX2P32243 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
OTX2P32243 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTX2P32243 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTX2P32243 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTX2P32243 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTX2P32243 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTX2P32243 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTX2P32243 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTX2P32243 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTX2P32243 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTX2P32243 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTX2P32243 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTX2P32243 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTX2P32243 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTX2P32243 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTX2P32243 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTX2P32243 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
OTX2P32243 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
OTX2P32243 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
OTX2P32243 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
OTX2P32243 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTX2P32243 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTX2P32243 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTX2P32243 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTX2P32243 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTX2P32243 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTX2P32243 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTX2P32243 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTX2P32243 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTX2P32243 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTX2P32243 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTX2P32243 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTX2P32243 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTX2P32243 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTX2P32243 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTX2P32243 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTX2P32243 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTX2P32243 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTX2P32243 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
OTX2P32243 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
OTX2P32243 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTX2P32243 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTX2P32243 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTX2P32243 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTX2P32243 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
OTX2P32243 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTX2P32243 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
OTX2P32243 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTX2P32243 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTX2P32243 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTX2P32243 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTX2P32243 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTX2P32243 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTX2P32243 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTX2P32243 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTX2P32243 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTX2P32243 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTX2P32243 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTX2P32243 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTX2P32243 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTX2P32243 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTX2P32243 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTX2P32243 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTX2P32243 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTX2P32243 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTX2P32243 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTX2P32243 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTX2P32243 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTX2P32243 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTX2P32243 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTX2P32243 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
OTX2P32243 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTX2P32243 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
OTX2P32243 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTX2P32243 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTX2P32243 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTX2P32243 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTX2P32243 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTX2P32243 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTX2P32243 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTX2P32243 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTX2P32243 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTX2P32243 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTX2P32243 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms