Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms